诛仙讲述了草庙村普通少年张小凡在机缘巧合下认识了普智高僧，普智临终前将天音寺不外传的真法“大梵般若”传授给小凡，希望能在张小凡身上圆自己佛道双修、参透生死的梦想。后来草庙村遭到血腥屠杀，小凡和林惊羽被名门正派青云门收留。

资质愚钝的张小凡进入“大竹峰”后，武艺修行进展缓慢，在一次伐竹过程中，为追一只三眼灵猴，获得了一件以自己精血炼成的至凶至邪之法宝烧火棍”。在此后青云的“七脉会武”中，最不被看好的张小凡凭运气和“烧火棍”的邪气，竟然进入前四。

在比武中，他邂逅了“小竹峰”中冷艳绝俗的陆雪琪并败在她手下。后来，比试前四名去空桑山调查魔教异常之事，小凡、雪琪落入死灵渊，在危急时两人不离不弃，互生情愫，后被黑水玄蛇打散。张小凡落入滴血洞，在洞中认识了魔教鬼王宗宗主女儿碧瑶，并无意中习得魔教天书。

在第一次正魔大战之中，困扰小凡多年的草庙村血案真相大白，小凡伤心激愤，又因碧瑶不顾生死以痴情咒为他挡下诛仙剑阵，所以张小凡叛出青云加入魔教，更名鬼厉。十年间，鬼厉杀人无数，冷漠嗜血的同时他也走遍大江南北，寻求复活碧瑶的良方。

在此之后，鬼厉结识并解救了因偷玄火鉴而遭囚禁的九尾天狐小白，两人潜入苗疆寻求使碧瑶复活的方法。历经艰难找到苗疆大巫师，无奈大巫师油尽灯枯，还魂术并未成功期间，南疆兽妖开始大举北进，天下生灵涂炭，正魔中人纷纷攻打兽神镇魔洞中，鬼厉雪琪合作历经艰险最终战胜兽神。

在苗疆的夜空下，两人不管明天，忘却世间的牵绊，轻轻地相拥。鬼王不顾众人死活，炼就四灵血阵。后在四灵血阵大功告成时，引发狐歧山崩塌。碧瑶肉身从此失踪，下落不明，只留下一角绿色衣裳。张小凡因此大受打击，后在陆雪琪的呵护以及小白的打骂下重新振作、

在古剑诛仙的召唤下来到幻月洞府，成为诛仙剑的新主人且同时习得天书第五卷，在第二次正魔大战中，杀死了鬼王，拯救了世间百姓，在与陆雪琪失散后，回到草庙村，两人终又重逢

故事是从一个叫做张小凡的普通少年开始的。机缘巧合，一位天音寺名为普智的高僧在临终前传授给他天音寺不外传的真法“大梵般若”，希望能在张小凡身上圆自己佛道双修，参透生死的梦。

后来草庙村遭到血腥屠杀，小凡和林惊羽被名门正派青云门收留。