结局是在神兵小将中玄天邪帝最后被男主角南宫问天和他的小伙伴们一起打败了，原始天魔的阴谋再次失败，玄天邪帝原本是一个国家的国王，但是因为他的国家遭到了大灾难，百姓们遭到了饥荒，所以当时的玄天邪帝想要通过发动战争来向邻国获得粮食来拯救自己的百姓，但是没想到他生出的恶念被原始天魔给知晓了，把它变成了玄天邪帝，但是在最后他的意识也苏醒了。

52集大结局：虽然所有神兽都失去了本性，可是在孩子们与自己曾经的神兽作战的同时，问天收到了玉龙国女元首的启示：友谊。孩子们把深受们恢复本性后，用“团结天晶”打败了天地盟主，救出女元首。女元首封问天等人为“神兵小将”。

在最后一集，所有的圣兽都来帮助问天打天地盟主，然后圣兽们被虎魄变成了邪恶的魔兽，然后攻击自己的主人之后在圣兽们的主人的呼唤下，所有的圣兽恢复了正常，然后全部的圣兽变身，然后将力量集中在了天晶兽身上，然后问天击败了天地盟主。

在最后一集，所有的圣兽都来帮助问天打天地盟主，然后圣兽们被虎魄变成了邪恶的魔兽，然后攻击自己的主人之后在圣兽们的主人的呼唤下，所有的圣兽恢复了正常，然后全部的圣兽变身，然后将力量集中在了天晶兽身上，然后问天击败了天地盟主。